独立学院和民办高校收费不一样。独立学院尽管在教育部的高等教育类型序列当中也列在民办高校系列，但实际上办学性质有很大的不同，独立学院是公办高校与社会资本合作办学的一种高等教育类型，收费介于公办高校与民办高校之间，如江西省公办高校收费一般在5000左右，民办高校收费一般在18000以上，而独立学院一般在14000左右。
民办院校是指企业事业单位、社会团体及其他社会组织和公民个人利用非国家财政性教育经费，面向社会举办的高等学校及其教育机构。
其办学层次分专科和本科，学校运营经费基本由创办方或学校自己提供，资金相对紧张，所以学费要比公立贵很多，一般在16000元~20000元/年左右。
独立院校是指本科以上学历教育的普通高等学校与国家机构以外的社会组织或个人合作，即设立在某个大学的名下，利用非国家财政性经费举办的实施本科学历教育的高等学校。
运营资金来源和民办一样来源于非国家财政经费，所以学费和民办一样也比较高，一般在16000元~18000元/年左右。
1.民办高校是按照民办教育促进法设立的，而独立学院是行政规章设立的。独立学院一定是本科，而民办高校专本科都有。
2.独立学院的举办方一定是普通高校，合作方是社会力量，而民办则只有社会力量作为举办者，这是区分两者的最简单的一点。
3.民办就是有自己的校名，自己组织，自己的师资，自己的校园，自己独立颁发毕业证书。
4.独立学院一般设在某个大学名下。比如山西大学商务学院，海南大学三亚学院等，这些学院，可能和挂名的大学同在一个校园，也可能有师资等方面的共享和交流，而民办学院没有这方面的优势。
两者都是法人性质，有独立的财政体系，自付盈亏，处于全部自费状态。
5.独立学院可以毕业时，如果成绩好可以使用挂名院校的毕业证。这种毕业证可能也略有差别。比如北大本校毕业生领取红色的毕业证，而独立学院的北大毕业证是蓝色的。
一、办学主体不同
民办院校的办学主体是社会力量办学，包括个人或者社会机构办学;独立学院的办学主体是普通高校，合作者是社会力量。民办院校是按照民办教育促进法设立的，独立学院是教育行政规章设立的。
二、办学层次不同
独立学院是指实施本科以上学历教育的普通高等学校与国家机构以外的社会组织或者个人合伙创立，因此独立学院一定是本科。而民办高校中专、本科都有。
三、学校名称不同
从学校名称上看，民办院校都有自己的校名，而独立学院则是设立在某一个大学名下，比如厦门大学嘉庚学院、四川大学锦江学院、吉林大学珠海学院、燕山大学里仁学院、中国传媒大学南广学院等。
四、学历证书不同
独立学院和民办院校的毕业生都可以获得国家承认的学历证书，毕业证书均可以在中国高等教育学生信息网上查询得到。但是，独立学院毕业证书上加盖的是某某大学某某学院的印章，而学校本部学生的毕业证书只盖有自己学校校名的印章。而民办院校的毕业证书上印章就是学校校名。
