平行志愿采用“分数优先，遵循志愿，一轮投档”的投档原则。录取时，首先将达到批次录取最低控制分数线的考生，按考生成绩从高到低排序，由计算机对每个考生所填报的平行院校志愿，依次检索，并且只投档一次。投档时，计算机先后依次检索每个考生的志愿，一经出现符合投档条件的院校且有计划余额，即向该院校投档。如：检索（甲）考生填报的A学校，成绩不够，不符合投档要求，则将检索（甲）考生填报的B学校，若符合B院校的投档条件，B院校有计划余额，则向B院校投档。在这个过程中，考生不会因为将B院校放在了自己志愿填报的第二位置而受到B学校的“歧视”，而是和其他在第一位置填报B学校的考生一样竞争，依次类推。
1.政策性退档
根据教育部规定，由于我国教育资源不足，省招生委员会根据考生成绩，从高分到低分，按105%-120%计划招生总数确定控制分数线，既然多余100%的确定控制分数线，那么100%以外的部分在录取过程中就有可能落榜。这就是政策性落榜。
2.专业不服从调剂
近年来因不服从专业调剂而被退档的考生也是很多的，因为有的考生在填写志愿的时候会选择不服从调剂，那么在自己选择的专业被录满的时候，留给考生的只能是被院校退档。
3.相关科目分数不够
部分院校在招生的时候会对考生的某些相关科目的分数有要求，即使考生的总成绩达到要求，但是因为单科成绩不足可也能会被退档。所以考生在报考的时候一定要看好院校的招生简章，不要盲目选择。
5.身体条件不符
部分院校的专业对考生自身有条件限制，如身高、体重、听力、嗅觉、视力（色盲、色弱）等，如果不符合条件，一样会被退档。
第一、没有同意专业服从调剂。考生的分数已经过了院校的提档线，但是不满足所报专业的分数，在还有其他专业有缺额的情况下，同意调剂则会被学校录取，不同意调剂就会被退档，档案被退回省招生办。这种情况下，学生只能参加征集志愿或者在下一批次填报。面对此种原因，解决方案只有一个就是每个院校志愿都要服从专业调剂。
第二、考生条件没有符合院校要求。考生在提档后，分数符合所报专业的分数，档案状态变为预录取，可是后来还是被退档，这是为什么？造成这一现象的主要原因就是学生的身体状况或者政审没有合格再或者是考生所报考的专业有单科成绩的要求没有满足。
这种情况的避免方式就是在填写志愿之前仔细阅读院校的招生简章，里面有严格的要求。
比如某些专业要求数学或者其他科目的成绩在105或者120分以上；部分院校尤其是民族院校对汉族和少数民族考生录取有限制，有院校注明只招收民族考生，这样汉族考生就要避免报考。还有的院校专业如地矿类、轮机工程、航海技术等专业不招收女生，护理学专业有学校注明不招收男生；
高校招生中部分专业对考生的年龄是有特殊要求的，如军事类院校、武警、公安现役院校等等。还有的专业对视力，身高，听力等等身体健康的条件也有明确的规定。只有仔细的阅读招生章程，了解所有要求，才能在填报中避免这些不符合条件的专业，确保不会被退档。
