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学校占地面积约100亩，有60个教学班，在校学生约3080人。学校绿树成荫，湖光掩映，素有“校风好、学风浓”的美称。学校拥有一支师德高尚、教风严谨、业务精湛的教师队伍，其中在职全国名校长、广州市名校长、番禺区首届名校长1人，广州市劳动模范2人，特级教师2人，广东省名师工作室主持人1人，广州市名师工作室主持人3人；高级教师122人，一级教师93人。硕士研究生学历58人，南粤优秀教师（教坛新秀 ）7人，广州市名教师3人，广州市道德模范1人，番禺名教师6人，全国先进工作者和省市区优秀教师一大批；广州市高考研究组成员、市区两级学科中心组成员、特约教研员、学科研究会理事等41人。一批教学骨干常年活跃在国家、省、市各学科的专业学术团体活动中，参与广州市中考、高中学业水平测试、广东省高考的命题工作，成为颇具影响的名师、专家。
历年高考重点率、高分人数、各科平均分，稳居广州市、广东省前列。2000年以来先后有21人成为高考总分和单科广东省状元。自1996年起连续十八年获广州市高三毕业班工作综合评比一等奖，其中2007、2008、2010、2011和均获广州市一等奖总分第1名，2012和2013年获广州市一等奖总分第2名；2000年郭志勇同学获全国高考广东省化学科状元，2001年彭炎聪同学获全国高考广东省化学科状元，2004年梁妍钰同学获全国高考广东省语文科状元，2005年梁烨妮同学获全国高考广东省语文科状元，2007年颜晖皓同学获全国高考广东省化学类五科总分状元，2008年陈德健、何畅、梁胜仔三位同学分别获得物理、历史、理科综合广州市单科第一名，有十一位同学位列广州市各单科的前十名。2009年郭宇成等14位同学以150分满分获得广东省理科基础第一名，位列省市前茅。2010年高考，再次改写番禺高考的辉煌历史，周于敬同学以709分勇夺全国高考广东省理科总分状元，被清华大学建筑设计学院优先录取。李杰锋同学理科综合287分、陈乐同学语文137分，位居广东省前列。2015年高考，我校各批次特别是重点本科上线人数实现新突破，重点本科上线人数643人，位居广州市各高中之首，比广州市重本预测540人多103人，重本上线率65.43%，位居广州市各区属高中之首，重本率比去年增加6个百分点；本科A上线人数942人，上线率达93%，本科B上线人数990人，上线率97.22%，均创历史新高。
学校坚持特色立校、科研兴校、质量强校，以科研为引领，以课程为平台，以社团为依托，以培优为磨炼，全面实行素质教育。近年还积极探索，大胆创新，率先进行“研学后教”之“五环学习法”模式的课堂教学改革，学生小组围桌上课，自主学习、教师点拨和课堂展示相结合，彻底改变传统“满堂灌”的教学模式，实现“以师为本、以教为主”向“以生为本、以学为主”的转变，真正做到“把时间还给学生，把方法教给学生，把机会让给学生”。近五年学生参加各类竞赛获国际级和国家、省市级奖项超过400人次，其中钟逸峤、陶叶帆、梁子彬和莫梓亮等同学荣获全国数学、化学竞赛一等奖；袁健进同学代表国家队参加广州第16届亚运会速度轮滑比赛，获亚洲第五名。学生社团“模拟联合国、校园电视台、辩论社、义工队、银杏文学社、动漫社、击剑队、定向运动社、合唱队、舞蹈队”等在国内国际各类比赛中获得众多奖项。仲元作为新课程实验的省级样本校，除了高质量开齐开好国家必修课程选修课堂外，还开发近20余门校本选修课程以及广州市立项的特色课程《君子之风教育》，为全体学生的个性化发展服务。
由于办学成绩显著，学校先后评为首批广东省一级学校，首批广东省国家级示范性普通高中，2005至2015年连续六届评为“中国百强中学”，“全国名优学校”、“广东省普教系统先进单位”、“全国体育传统项目先进学校”、“广东省群众体育先进单位”、“广东省依法治校示范校”、“广东省绿色学校”、“广州市文明单位”、“广东省中小学校本培训示范学校”、“北京2008奥林匹克教育示范学校”、“广州市创先争优先进基层党组织”、“广州市番禺区五一劳动奖状”、“全国消防安全教育示范学校”等荣誉称号。
