上海交通大学双一流学科有：数学、物理学、化学、生物学、机械工程、材料科学与工程、电子科学与技术、信息与通信工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、土木工程、化学工程与技术、船舶与海洋工程、基础医学、临床医学、口腔医学、药学、工商管理等18个。
| 序号 | 学科名称 |
| 1 | 数学 |
| 2 | 物理学 |
| 3 | 化学 |
| 4 | 生物学 |
| 5 | 机械工程 |
| 6 | 材料科学与工程 |
| 7 | 电子科学与技术 |
| 8 | 信息与通信工程 |
| 9 | 控制科学与工程 |
| 10 | 计算机科学与技术 |
| 11 | 土木工程 |
| 12 | 化学工程与技术 |
| 13 | 船舶与海洋工程 |
| 14 | 基础医学 |
| 15 | 临床医学 |
| 16 | 口腔医学 |
| 17 | 药学 |
| 18 | 工商管理 |
| 序号 | 学校名称 | 一级学科名称 | 评估结果 |
| 1 | 上海交通大学 | 生物学 | A+ |
| 2 | 上海交通大学 | 机械工程 | A+ |
| 3 | 上海交通大学 | 船舶与海洋工程 | A+ |
| 4 | 上海交通大学 | 临床医学 | A+ |
| 5 | 上海交通大学 | 工商管理 | A+ |
| 6 | 上海交通大学 | 外国语言文学 | A |
| 7 | 上海交通大学 | 数学 | A |
| 8 | 上海交通大学 | 物理学 | A |
| 9 | 上海交通大学 | 材料科学与工程 | A |
| 10 | 上海交通大学 | 动力工程及工程热物理 | A |
| 11 | 上海交通大学 | 信息与通信工程 | A |
| 12 | 上海交通大学 | 控制科学与工程 | A |
| 13 | 上海交通大学 | 计算机科学与技术 | A |
| 14 | 上海交通大学 | 生物医学工程 | A |
| 15 | 上海交通大学 | 管理科学与工程 | A |
| 16 | 上海交通大学 | 法学 | A- |
| 17 | 上海交通大学 | 新闻传播学 | A- |
| 18 | 上海交通大学 | 化学 | A- |
| 19 | 上海交通大学 | 仪器科学与技术 | A- |
| 20 | 上海交通大学 | 电子科学与技术 | A- |
| 21 | 上海交通大学 | 环境科学与工程 | A- |
| 22 | 上海交通大学 | 软件工程 | A- |
| 23 | 上海交通大学 | 基础医学 | A- |
| 24 | 上海交通大学 | 药学 | A- |
| 25 | 上海交通大学 | 公共管理 | A- |
| 26 | 上海交通大学 | 科学技术史 | B+ |
| 27 | 上海交通大学 | 生态学 | B+ |
| 28 | 上海交通大学 | 力学 | B+ |
| 29 | 上海交通大学 | 电气工程 | B+ |
| 30 | 上海交通大学 | 土木工程 | B+ |
| 31 | 上海交通大学 | 化学工程与技术 | B+ |
| 32 | 上海交通大学 | 口腔医学 | B+ |
| 33 | 上海交通大学 | 护理学 | B+ |
| 34 | 上海交通大学 | 设计学 | B+ |
| 35 | 上海交通大学 | 马克思主义理论 | B |
| 36 | 上海交通大学 | 统计学 | B |
| 37 | 上海交通大学 | 核科学与技术 | B |
| 38 | 上海交通大学 | 园艺学 | B |
| 39 | 上海交通大学 | 中国语言文学 | B- |
| 40 | 上海交通大学 | 食品科学与工程 | B- |
| 41 | 上海交通大学 | 风景园林学 | B- |
| 42 | 上海交通大学 | 公共卫生与预防医学 | B- |
| 43 | 上海交通大学 | 政治学 | C+ |
| 44 | 上海交通大学 | 天文学 | C+ |
| 45 | 上海交通大学 | 建筑学 | C+ |
| 46 | 上海交通大学 | 交通运输工程 | C+ |
| 47 | 上海交通大学 | 航空宇航科学与技术 | C+ |
| 48 | 上海交通大学 | 中西医结合 | C+ |
| 49 | 上海交通大学 | 中国史 | C |
| 50 | 上海交通大学 | 畜牧学 | C- |
