独立学院是本科，而民办学院是本科、专科都有。独立学院是按照教育部行政规章设立的，而民办学院是按照民办教育促进法设立的。
民办学院有自己的校名、组织机构、师资力量和自己独立颁发的毕业证书。但是独立学院一般都是在某个大学名下设立的。可能会和挂名大学在同一个校园，也可能在师资量方面有共享，这是民办学院没有的优势。
独立学院毕业时，如果成绩好的学生可以推荐使用挂名院校的毕业证书，但是毕业证书上可能会略有差别。但是民办学院会有自己的毕业证书。
独立学院因为不是公办院校，所以一般学费都会比较贵，基本学费都在一万以上，独立院校大多是在本科三批招生，但是现在在很多省市都合并到本科二批招生了。
独立学院和民办学院都是属于民办性质，所以两者的学费标准差不多，开设的专业也都是比较热门的专业，录取分数方面也都是互有长短，所以，对于很多考生和家长来说，都不知道选择哪一个比较好。小编在这里只能说，这两者不可比，他们都各有各的优势和特点。
民办学院在我国已经开办了几十年了，在这其中也有很多好学校，都是比较有名气的。而独立学院的开办历史并没有民办学院那么长，但是独立学院的优势在于依托挂名学院的优质教育资源和师资力量，起点上比较高，这一点优势是民办学院没有的。
在有些省份，民办学院和独立学院并没有安排在同一个批次录取，有的在二本批次，有的在三本批次。很多考生就会认为，本科二批录取的院校一定比本科三批录取的院校好，对于这一点，是无可厚非的，因为每个人都有自己的判断。
独立学院的招生是通过学院办学所在的省市，根据参加全国高考统一招生的招生计划的基础上，实施降低分数的方式进行的。独立学院的毕业生将获得获国家承认的学历证书。与学校本部毕业证书不同的是，其毕业证书上加盖的是某某大学某某学院印章，而学校本部学生的毕业证书只盖有学校校名印章。
独立学院与大学内部学院的重要区别还在于其独立性。独立学院有独立的校园和基本办学设施，实施相对独立的教学组织和管理，独立进行招生，独立颁发学历证书，独立进行财务核算，应具有独立法人资格，能独立承担民事责任。独立学院还按国家有关教育事业统计工作的规定，独立填报《高等教育基层统计报表》。在性质上是一所完全独立的院校，与所属的大学关系并不大。
