| 排名 | 大学院校 | 等级 |
| 1 | 东南大学 | A+ |
| 2 | 华中科技大学 | |
| 3 | 上海交通大学 | A |
| 4 | 清华大学 | A- |
| 5 | 北京航空航天大学 | |
| 6 | 浙江大学 | |
| 7 | 四川大学 | |
| 8 | 北京大学 | B+ |
| 9 | 天津大学 | |
| 10 | 复旦大学 | |
| 11 | 华南理工大学 | |
| 12 | 重庆大学 | |
| 13 | 电子科技大学 | |
| 14 | 西安交通大学 | |
| 15 | 北京工业大学 | B |
| 16 | 北京理工大学 | |
| 17 | 哈尔滨工业大学 | |
| 18 | 上海理工大学 | |
| 19 | 深圳大学 | |
| 20 | 南方医科大学 | |
| 21 | 第四军医大学 | |
| 22 | 首都医科大学 | B- |
| 23 | 大连理工大学 | |
| 24 | 东北大学 | |
| 25 | 哈尔滨医科大学 | |
| 26 | 同济大学 | |
| 27 | 中国科学技术大学 | |
| 28 | 中山大学 | |
| 29 | 暨南大学 | |
| 30 | 天津医科大学 | C+ |
| 31 | 南京大学 | |
| 32 | 温州医科大学 | |
| 33 | 山东大学 | |
| 34 | 西北工业大学 | |
| 35 | 西安电子科技大学 | |
| 36 | 太原理工大学 | C |
| 37 | 苏州大学 | |
| 38 | 厦门大学 | |
| 39 | 武汉大学 | |
| 40 | 西南交通大学 | |
| 41 | 湖南工业大学 | |
| 42 | 国防科技大学 | |
| 43 | 北京邮电大学 | C- |
| 44 | 河北工业大学 | |
| 45 | 吉林大学 | |
| 46 | 长春理工大学 | |
| 47 | 哈尔滨工程大学 | |
| 48 | 东华大学 | |
| 49 | 南京航空航天大学 |
生物医学工程专业评估体系等级排名以诸多因素为综合参照,生物医学工程专业评估数据以“公共数据和单位填报相结合”的方式获取;评估结果按“分档”方式呈现,具体方法是按“学科整体水平得分”的位次百分位,将前70%的生物医学工程学科分9档公布:前2%(或前2名)为生物医学工程A+院校,2%～5%为生物医学工程A院校(不含2%,下同),5%～10%为生物医学工程A-院校,10%～20%为生物医学工程B+院校,20%～30%为生物医学工程B院校,30%～40%为生物医学工程B-院校,40%～50%生物医学工程C+院校,50%～60%为生物医学工程C院校,60%～70%为生物医学工程C-院校。
