以下是南京信息工程大学招生信息网公布的各学院最新专业名单:
| 院系名称 | 专业名称 |
| 长望学院 | 1 地理信息科学(与中国科学院大学联合培养) |
| 2 地理信息科学(与中国科学院大学联合培养) | |
| 3 电子信息类(与中国科学院大学联合培养) | |
| 4 电子信息类(与中国科学院大学联合培养) | |
| 5 环境科学与工程类(与中国科学院大学联合培养) | |
| 6 环境科学与工程类(与中国科学院大学联合培养) | |
| 7 农业资源与环境(与中国科学院大学联合培养) | |
| 8 农业资源与环境(与中国科学院大学联合培养) | |
| 9 人文地理与城乡规划(与中国科学院大学联合培养) | |
| 10 人文地理与城乡规划(与中国科学院大学联合培养) | |
| 11 生态学(与中国科学院大学联合培养) | |
| 12 生态学(与中国科学院大学联合培养) | |
| 13 遥感科学与技术(与中国科学院大学联合培养) | |
| 14 遥感科学与技术(与中国科学院大学联合培养) | |
| 15 自然地理与资源环境(与中国科学院大学联合培养) | |
| 16 自然地理与资源环境(与中国科学院大学联合培养) | |
| 地理科学学院 | 1 地理信息科学 |
| 2 自然地理与资源环境 | |
| 大气科学学院 | 1 大气科学 |
| 2 大气科学类 | |
| 3 大气科学类(含大气科学、大气科学(大气物) | |
| 应用气象学院 | 1 农业资源与环境 |
| 2 生态学 | |
| 3 应用气象学 | |
| 4 应用气象学(公共气象服务) | |
| 大气物理学院 | 1 安全工程 |
| 2 大气科学(大气探测) | |
| 3 大气科学(大气物理) | |
| 地理与科学学院 | 1 地理信息科学 |
| 2 人文地理与城乡规划 | |
| 3 自然地理与资源环境 | |
| 遥感与测绘工程学院 | 1 测绘工程 |
| 2 遥感科学与技术 | |
| 水文与水资源工程学院 | 1 大气科学(水文气象) |
| 2 水文与水资源工程 | |
| 海洋科学学院 | 1 海洋技术 |
| 2 海洋科学 | |
| 信息与控制学院 | 1 测控技术与仪器 |
| 2 测控技术与仪器(嵌入式培养) | |
| 3 电气工程及其自动化 | |
| 4 机器人工程 | |
| 5 数据科学与大数据技术 | |
| 6 自动化 |
大气科学、应用气象学、环境科学、电子信息工程、计算机科学与技术
大气科学、信息与计算科学
雷电防护科学与技术、电子信息工程、环境工程
大气科学
气象学
大气物理学与大气环境
大气物理学与大气环境
大气科学
大气科学
天气动力学、大气探测与大气遥感、农业气象学、气候学、海洋科学、信息与通信工程、仪器科学与技术、电子科学与技术、公共管理、环境科学与工程、计算机科学与技术、管理科学与工程、工商管理、数学、物理学、光学工程、系统科学、地理学、农业资源利用
