中国科学技术大学双一流专业有：数学、物理学、化学、天文学、地球物理学、生物学、科学技术史、材料科学与工程、计算机科学与技术、核科学与技术、安全科学与工程等11个双一流专业。
| 序号 | 双一流学科名单 |
| 1 | 数学 |
| 2 | 物理学 |
| 3 | 化学 |
| 4 | 天文学 |
| 5 | 地球物理学 |
| 6 | 生物学 |
| 7 | 科学技术史 |
| 8 | 材料科学与工程 |
| 9 | 计算机科学与技术 |
| 10 | 核科学与技术 |
| 11 | 安全科学与工程 |
| 序号 | 学校名称 | 一级学科名称 | 评估结果 |
| 1 | 中国科学技术大学 | 物理学 | A+ |
| 2 | 中国科学技术大学 | 化学 | A+ |
| 3 | 中国科学技术大学 | 天文学 | A+ |
| 4 | 中国科学技术大学 | 地球物理学 | A+ |
| 5 | 中国科学技术大学 | 科学技术史 | A+ |
| 6 | 中国科学技术大学 | 核科学与技术 | A+ |
| 7 | 中国科学技术大学 | 安全科学与工程 | A+ |
| 8 | 中国科学技术大学 | 数学 | A |
| 9 | 中国科学技术大学 | 生物学 | A |
| 10 | 中国科学技术大学 | 统计学 | A- |
| 11 | 中国科学技术大学 | 材料科学与工程 | A- |
| 12 | 中国科学技术大学 | 计算机科学与技术 | A- |
| 13 | 中国科学技术大学 | 环境科学与工程 | A- |
| 14 | 中国科学技术大学 | 软件工程 | A- |
| 15 | 中国科学技术大学 | 管理科学与工程 | A- |
| 16 | 中国科学技术大学 | 生态学 | B+ |
| 17 | 中国科学技术大学 | 力学 | B+ |
| 18 | 中国科学技术大学 | 仪器科学与技术 | B+ |
| 19 | 中国科学技术大学 | 动力工程及工程热物理 | B+ |
| 20 | 中国科学技术大学 | 信息与通信工程 | B+ |
| 21 | 中国科学技术大学 | 控制科学与工程 | B+ |
| 22 | 中国科学技术大学 | 工商管理 | B+ |
| 23 | 中国科学技术大学 | 地质学 | B |
| 24 | 中国科学技术大学 | 电子科学与技术 | B |
| 25 | 中国科学技术大学 | 公共管理 | B |
| 26 | 中国科学技术大学 | 光学工程 | B- |
| 27 | 中国科学技术大学 | 生物医学工程 | B- |
| 28 | 中国科学技术大学 | 大气科学 | C- |
